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1. 基于高通量测序对南极菲尔德斯半岛土壤微生物多样性的初步研究
李桂秀 宋易洋 赵芯 王国良
   2020, 42 (3): 195-204.  
摘要226)      PDF (4205KB)(349)    收藏
南极地区环境恶劣、人迹罕至但微生物较为丰富,土壤中存在着极为丰富的微生物群落,这些土壤微生物为适应南极极端环境形成了独特的生物多样性、遗传机制和代谢途径。本文为了探究南极地区土壤微生物的生物多样性和群落结构,以中国第31次南极科学考察采自菲尔德斯半岛3个站点的土壤样本作为研究对象,提取土壤微生物的宏基因组DNA,基于Illumina NovaSeq 6000测序平台和Paired-end 150测序策略进行高通量测序,通过生物信息学分析对南极土壤微生物的多样性进行了初步研究。使用MetaPhlAn2进行数据分析并用GraPhlAn对结果进行可视化,结果显示3例土壤样本中的微生物来自于8门14纲21目32科48属62种,其中假单胞杆菌属(Pseudomonas)是优势细菌菌群,白色念珠菌(Candida albicans)是优势真菌菌群。通过分析菲尔德斯半岛采集的样本,表明南极地区具有丰富的微生物种群多样性。本研究不仅有助于探究南极等极端环境中微生物的物种多样性,还为后期新菌的分离培养、活性物质的提取、功能基因的筛选、群落结构的研究等提供了实验依据和信息资源。
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